Em 1594, chegaram os primeiros religiosos (padres) e, somente, em 12 de janeiro de 1755, o governo concedeu o título de Freguesia ao Curato de N. S. de Nazareth de Saquarema.  No final do século XVII a cultura do café sobressaía em Saquarema que, em 08 de maio 1841, obteve a sua emancipação político-administrativa, quando o Visconde de Baependi, Vice Presidente da Província, concedeu a categoria de Município ao Arraial de Nossa Senhora de Saquarema, que até então pertencia à Comarca de Cabo Frio.